O trabalho evangélico congregacional em Cuiabá nasceu do coração missionário do Departamento de Evangelização e Missões (DEM) da União das Igrejas Evangélicas Congregacionais do Brasil, sob a presidência do Rev. Jair Álvares Pintor.
No dia 19 de janeiro de 1983, chegaram à capital mato-grossense o pastor Jair José Rodrigues, sua esposa Lenira Lopes Rodrigues e seus filhos Jailene, Janderson e Jane, movidos por um mesmo propósito: plantar uma igreja congregacional em Cuiabá.
Em 28 de fevereiro de 1983, às 19h30, foi realizado o primeiro culto público, na residência pastoral, situada à Rua São José Operário, nº 130, Bairro Dom Aquino.
O culto teve início com o cântico nº 244 do Salmos e Hinos e uma oração conduzida pelo irmão José de Barros. Após o período de louvor, o pastor Jair leu Mateus 5:1–12 e trouxe a mensagem evangelística intitulada “A bem-aventurança pela pobreza”.
Naquele tempo, já havia em Cuiabá e Várzea Grande alguns irmãos congregacionais, que se tornaram membros fundadores:
José Barros, Raimunda de Souza Barros, Deuseni de Souza Barros, Moseli de Souza Barros, José de Barros Júnior, Marcos Cezar Gonçalves de Moura, Solange Corrêa Peixoto de Moura, Mariko Semoto Antoniete, Nelson Antoniete, Leide Antoniete e Neide Antoniete.
Com o crescimento do grupo, surgiu a necessidade de um espaço maior. A partir de julho de 1983, os cultos passaram a ser realizados em um salão alugado na Rua Dom Bosco, nº 410, próximo ao Colégio São Gonçalo.
No final do mesmo ano, o local já se tornara pequeno. Assim, em março de 1984, a igreja alugou um salão mais amplo, no mesmo prédio — um espaço que antes servia de ponto de encontro para pessoas viciadas em álcool, e que agora se tornava um lugar de louvor e adoração ao Senhor.
A primeira propriedade adquirida pelo DEM não se mostrou adequada à construção de um templo. Com autorização do departamento, o terreno foi vendido por CR$ 4.500,00, e, posteriormente, mais CR$ 2.000,00 foram enviados pelo DEM, possibilitando a compra do primeiro terreno próprio, onde o templo foi edificado.
Durante a gestão do pastor Ilton Aguiar, o irmão João Antoniete Júnior, que havia trabalhado no Japão, entregou um dízimo acumulado que permitiu à igreja adquirir o terreno vizinho.
Em março de 1985, teve início a construção do templo, e em julho do mesmo ano, mesmo sem os acabamentos finais, o espaço passou a ser utilizado para os cultos. O DEM contribuiu com uma pequena parte dos recursos, mas 80% do valor investido veio do esforço e da dedicação dos irmãos locais — um verdadeiro testemunho de fé e união.
O pastor Jair José Rodrigues liderou a Igreja Evangélica Congregacional de Cuiabá por sete anos ininterruptos, até dezembro de 1989, quando solicitou ao DEM a vinda de um novo obreiro. Ele permaneceu à frente da igreja até abril de 1990, quando assumiu o pastor Ilton de Aguiar, permanecendo até dezembro de 1993.
Nos meses de janeiro e fevereiro de 1994, o pastor Jair voltou a servir interinamente, até a chegada do pastor Nilson Ferreira Braga, empossado em 28 de fevereiro de 1994. O pastor Nilson pastoreou a igreja até janeiro de 1999, quando faleceu tragicamente em um acidente automobilístico.
Após esse período, o pastor Jair voltou a liderar a igreja, conciliando o ministério pastoral com o magistério em escolas públicas de Várzea Grande e a direção do Seminário Congregacional – Extensão Cuiabá. Essa fase desafiadora se estendeu de janeiro de 1999 a março de 2002.
Em seguida, a missionária Lília Tereza Santos Braga assumiu a liderança interina até maio de 2003, sob orientação do DEM e do pastor Eliezer Duarte, secretário executivo de Missões.
De junho de 2003 a maio de 2006, o pastor Sérgio Paulo Gil de Alcântara esteve à frente da igreja.
Em junho de 2006, o pastor Jair José Rodrigues reassumiu o pastorado, servindo até janeiro de 2010.
A partir de fevereiro de 2010, a liderança passou ao pastor Marcelo Pecora Ourives, que permaneceu até 30 de dezembro de 2024.
Atualmente, a Igreja Evangélica Congregacional de Cuiabá está sob os cuidados pastorais do Pr. Márcio Ricardo Pereira Silva, que continua conduzindo, com fé e dedicação, a obra iniciada em 1983.
Mais de quatro décadas depois, seguimos firmes no propósito de anunciar o Evangelho, edificar vidas e glorificar o nome de Deus — o mesmo sonho que motivou nossos primeiros irmãos e que, pela graça do Senhor, continua vivo em nossos corações.